Carlos Fausto é doutor em antropologia pela UFRJ e pós-doutor pelo Laboratoire d’Anthropologie Sociale (Collège de France/CNRS). Foi professor visitante na École Pratique des Hautes Études, na École des Hautes Études en Sciences Sociales, na Universidade de Chicago e no Center for Latin American Studies da Universidade de Stanford. Atualmente é pesquisador 1-B da CNPq
Empreendeu pesquisas com povos indígenas na Amazônia, centradas em temas como parentesco, guerra, ritual, xamanismo, arte e memória. Diretor e produtor de filmes etnográficos, coordena projetos de capacitação e video-realização através do Vídeo nas Aldeias e da Associação Indígena Kuikuro do Alto Xingu (AIKAX). Dedica-se à documentação integral dos rituais kuikuro, sobretudo de seu universo musical.
Escreveu o livro Os índios antes do Brasil.